Το σύστημα διεξαγωγής του League Cup «Νίκος Σαμαράς» 2016-17 αποφάσισε το Δ.Σ. της ΕΣΑΠ στην συνεδρίαση που έγινε στην Πορταριά 17-18 Ιουλίου.
Αποφασίστηκε επιστροφή στο σύστημα των τεσσάρων ομίλων με τρεις ομάδες. Ο ΠΑΟΚ, o Ηρακλής Χαλκίδας, η Παναχαϊκή και η Κύζικος Νέας Περάμου ανέλαβαν τις έδρες των ομίλων.
Ο Δικέφαλος στον όμιλο που θα φιλοξενηθεί στο PAOK Sports Arena θα αντιμετωπίσει την Ορεστιάδα και τον Εθνικό Αλεξανδρούπολης.
Η Α΄φάση των ομίλων θα διεξαχθεί 14-16 Οκτωβρίου, μία εβδομάδα πριν από την έναρξη του πρωταθλήματος Volley League «Πάμε Στοίχημα» 2016-17.
Ο πρώτος κάθε ομίλου θα προκριθεί στο φάιναλ-4 που θα γίνει στην Κύπρο το τελευταίο σαββατοκύριακο του Ιανουαρίου 2017 (28-29/1) αλλά η έδρα θα αποφασιστεί σε συνεργασία με την κυπριακή ομοσπονδία.
Οι όμιλοι του League Cup «Νίκος Σαμαράς» 2016-17
Α΄όμιλος (Χαλκίδα): Ηρακλής Χαλκίδας, Ολυμπιακός, ΑΟΠ Κηφισιά
Β΄όμιλος (Πάτρα): Παναχαϊκή Πετοσφαίριση, Παναθηναϊκός, ΓΑΣ Παμβοχαϊκός
Γ΄όμιλος (Θεσσαλονίκη): ΠΑΟΚ, ΑΟ Ορεστιάδα, Εθνικός Αλεξανδρούπολης
Δ΄όμιλος (Η έδρα θα ανακοινωθεί άμεσα): Κύζικος Νέας Περάμου, Ηρακλής Πετοσφαίριση ΑΟ Φοίνικας Σύρου