Σε κεντρικό ξενοδοχείο έγινε η κλήρωση των τριών πρώτων φάσεων με τις Κυπελλούχες ομάδες των ΕΠΣ και τις ομάδες της Super League 2. Μέσα και ο Ιωνικός. Τα παιχνίδια με την πρώτη φάση του θεσμού θα γίνουν την 1η Σεπτεμβρίου και θα είναι μονά ανάμεσα σε Κυπελλούχες ομάδες των ΕΠΣ.
Η ανατροπή της τελευταίας στιγμής έγινε με τον Ιωνικό που πήρε μέρος στην κλήρωση και κληρώθηκε στη β’ φάση με την Ερμιονίδα.
Τη διαδικασία της κλήρωσης συντόνισε και παρουσίασε η δημοσιογράφος Ζέτα Θεοδωρακοπούλου και τη διαδικασία της κλήρωσης ανέλυσε ο πρόεδρος της Υποεπιτροπής του Κυπέλλου Ελλάδας και μέλος της Επιτροπής Διοργανώσεων, Γιάννης Ρέτσας. Την κλήρωση διενήργησε ο προπονητής Γιώργος Τσαμόπουλος, ο οποίος πέρσι διακρίθηκε ως προπονητής του Αστέρα Καισαριανής καθώς συμμετείχε ως την 5η φάση της διοργάνωσης, την υψηλότερη όπου έφτασε ερασιτεχνική ομάδα στο Κύπελλο Ελλάδας 2023-24.
Οι αγώνες στις τρεις πρώτες φάσεις, στις οποίες συμμετέχουν κυπελλούχοι και φιναλίστ ομάδες των ΕΠΣ και ομάδες της Super League 2, είναι μονοί και σε περίπτωση ισοπαλίας στην κανονική διάρκεια θα ακολουθήσει παράταση και εφόσον χρειαστεί η διαδικασία των πέναλτι.
Αναλυτικά:
1η ΦΑΣΗ (1η Σεπτεμβρίου)
1ο γκρουπ
Βύρων Καβάλας-Αρης Αβάτου
Προκρίθηκαν άνευ αγώνα οι ομάδες: Πανθρακικός, Δόξα Βώλακα, Ορέστης Ορεστιάδας.
2ο γκρουπ
ΑΕ Ευόσμου-Απόλλων Παραλιμνίου
Προκρίθηκαν άνευ αγώνα οι ομάδες: ΑΟ Σάρτης, Κιλκισιακός, Νάουσα
3ο γκρουπ
Απόλλων Κρ. Βρύσης-Εορδαϊκός
Προκρίθηκαν άνευ αγώνα οι ομάδες: Ερμής Αμυνταίου, Αστραπή Μεσοποταμίας
4ο γκρουπ
Ερμής Καναλίου-Αναγέννηση Αρτας
Προκρίθηκαν άνευ αγώνα οι ομάδες: Σπάρτακος, Θύελλα Κατσικά, ΑΕ Λευκίμμης
5ο γκρουπ
Ατρόμητος Παλαμά-Ακαδ. Πλαταμώνα
Προκρίθηκαν άνευ αγώνα οι ομάδες: Τρίκαλα, Ολυμπιακός Βόλου, Σμόλικας.
6ο γκρουπ
Ζάκυνθος-ΠΑΟ Βάρδας
Προκρίθηκαν άνευ αγώνα οι ομάδες: Παλληξουριακός, Θύελλα Πατρών
7ο γκρουπ
Εράνη Φιλιατρών-Πανλακωνικός
Προκρίθηκαν άνευ αγώνα οι ομάδες: Κόρινθος, ΑΕ Ερμιονιδας
8ο γκρουπ
Αγιος Δημήτριος-Ν. Αρτάκη
Προκρίθηκαν άνευ αγώνα οι ομάδες: Αστέρας Σταυρού,Απόλλων Ευπαλίου
9ο γκρουπ
Εθνικός-Αγιος Νικόλαος
Προκρίθηκαν άνευ αγώνα οι ομάδες: Μανδραϊκός, Επισκοπή, ΑΕ Κυδωνίας
10ο γκρουπ
ΑΕΡ Αφάντου-Σαρωνικός Αναβ.
Προκρίθηκαν άνευ αγώνα οι ομάδες: Νέα Ιωνία, Θύελλα Καμαρίου
11ο γκρουπ
Προκρίθηκαν άνευ αγώνα οι ομάδες: Αιγέας Πλωμαρίου, Διαγόρας Ραχων, Θύελλα Χαλκείου.
2η ΦΑΣΗ (8 Σεπτεμβρίου)
Ορέστης Ορεστιάδας – Μακεδονικός
Δόξα Βώλακα – Καβάλα
Βύρωνας Καβάλας ή Άρης Αβάτου – Κιλκισιακός
Πανθρακικός – ΑΟ Σάρτης
Ερμής Αμυνταίου – Ηρακλής
ΦΑΣ Νάουσα – Καμπανιακός
ΑΕ Ευόσμου ή Απόλλων Παραλιμνίου – Εθνικός Νέου Κεραμιδίου
Απόλλων Κρύας Βρύσης ή Εορδαϊκός – Αστραπή Μεσοποταμίας
Θύελλα Κατσικάς – ΑΕΛ
Σπάρτακος Γραικοχωρίου – ΠΑΣ Γιάννινα
Ερμής Καναλίου ή Αναγέννηση Άρτας – Παλληξουριακός
ΑΠΣ Ζάκυνθος ή ΠΑΟ Βάρδας – ΑΕ Λευκίμμης
Σμόλικας Φαλάνης – Αιγάλεω
Ολυμπιακός Βόλου – Παναχαϊκή
Ατρόμητος Παλαμά ή Ακαδημία Πλαταμώνα – Νίκη Βόλου
Τρίκαλα – Θύελλα Πατρών
ΑΕ Κυδωνίας – Πανιώνιος
ΑΟ Επισκοπής – Καλαμάτα
Εθνικός ή ΑΟ Αγίου Νικολάου – ΠΑΕ Χανιά
Μανδραϊκός – Αστέρας Σταυρού
ΑΕ Ερμιονίδας – Ιωνικός
ΠΑΣ Κόρινθος – Διαγόρας Ρόδου
Εράνη Φιλιατρών ή ΠΑΣ Σπάρτη – Θύελλα Καμαρίου
ΑΕΡ Αφάντου ή Σαρωνικός Αναβύσσου – Νέα Ιωνία
Θύελλα Χαλκειού – ΠΑΕ Ηλιούπολη
Διαγόρας Ικαρίας – Κηφισιά
ΑΕ Αγίου Δημητρίου ή ΑΟ Νέας Αρτάκης – Παναργειακός
Αιγέας Πλωμαρίου – Απόλλων Ευπαλίου
3η ΦΑΣΗ (15 Σεπτεμβρίου)
Πανθρακικός ή ΑΟ Σάρτης – ΑΕ Κυδωνίας ή Πανιώνιος
[ΑΕΡ Αφάντου ή Σαρωνικός Αναβύσσου] – Νέα Ιωνία – [Ερμής Καναλίου ή Αναγέννηση Άρτας] – Παλληξουριακός
[Βύρωνας Καβάλας ή Άρης Αβάτου] – Κιλκισιακός – [ΑΠΣ Ζάκυνθος ή ΠΑΟ Βάρδας] – ΑΕ Λευκίμμης
Σμόλικας Φαλάνης ή Αιγάλεω – Ερμής Αμυνταίου ή Ηρακλής
[Ατρόμητος Παλαμά ή Ακαδημία Πλαταμώνα] – Νίκη Βόλου – [Απόλλων Κρύας Βρύσης ή Εορδαϊκός] – Αστραπή Μεσοποταμίας
ΑΕ Ερμιονίδας ή Ιωνικός – Σπάρτακος Γραικοχωρίου ή ΠΑΣ Γιάννινα
Διαγόρας Ικαρίας ή Κηφισιά – [ΑΕ Ευόσμου ή Απόλλων Παραλιμνίου] – Εθνικός Νέου Κεραμιδίου
Τρίκαλα ή Θύελλα Πατρών – [ΑΕ Αγίου Δημητρίου ή ΑΟ Νέας Αρτάκης] – Παναργειακός
ΦΑΣ Νάουσα ή Καμπανιακός – Θύελλα Χαλκειού ή ΠΑΕ Ηλιούπολη
Ορέστης Ορεστιάδας ή Μακεδονικός – Θύελλα Κατσικάς ή ΑΕΛ
[Εράνη Φιλιατρών ή ΠΑΣ Σπάρτη] – Θύελλα Καμαρίου – ΠΑΣ Κόρινθος ή Διαγόρας Ρόδου
Δόξα Βώλακα ή Καβάλα – Αιγέας Πλωμαρίου ή Απόλλων Ευπαλίου
Ολυμπιακός Βόλου ή Παναχαϊκή – ΑΟ Επισκοπής ή Καλαμάτα
[Εθνικός ή ΑΟ Αγίου Νικολάου] – ΠΑΕ Χανιά – Μανδραϊκός ή Αστέρας Σταυρού
